Về ý kiến các trường phi công chọn học theo phương thức xã hội hoá đa số là các trường nhỏ lẻ, chất lượng đào tạo thấp, Cục HKVN cho rằng đây là các trường tổ chức đánh giá, công nhận người lái máy bay đã được cục hàng không của các quốc gia phê chuẩn, chủ yếu các trường tại Hoa Kỳ, New Zealand, Úc và châu Âu. Ngoài việc tổ chức huấn luyện được phê chuẩn bởi quốc gia thành viên Tổ chức Hàng không dân dụng quốc tế ICAO và được Cục HKVN đánh giá tuân thủ các quy định của Việt Nam, cá nhân người lái máy bay phải được cục hàng không của quốc gia tổ chức huấn luyện tổ chức kiểm tra, đánh giá để cấp bằng người lái máy bay (PPL, CPL/IR). Sau khi có bằng lái máy bay (CPL, IR), các phi công cơ bản sẽ được huấn luyện chuyển loại các loại máy bay, ví dụ A321, A350, B787…
Về các tồn tại, tiêu cực trong quá trình huấn luyện phi công, cụ thể là hiện tượng ra giá 20.000 USD - 30.000 USD cho mỗi suất phỏng vấn để nâng cấp, chuyển loại phi công, Cục HKVN cho rằng cần có thời gian để xác minh, đánh giá vì đây là hoạt động của các hãng hàng không.
Tuy nhiên, Cục HKVN khẳng định cơ quan này hoàn toàn độc lập với hoạt động của các hãng hàng không trong việc tuyển chọn và huấn luyện phi công. Các tồn tại do ĐBQH Nguyễn Sỹ Cương nêu ra không ảnh hưởng đến quá trình đánh giá độc lập, khách quan và chất lượng của Cục HKVN đối với các phi công trước khi được cấp bằng và cho phép hoạt động khai thác.