Ban Chỉ đạo do Chủ tịch UBND TPHCM Phan Văn Mãi làm Trưởng ban. Các Phó Trưởng Ban gồm: Phó Chủ tịch Thường trực HĐND TPHCM, Trưởng ban Ban Tuyên giáo Thành ủy; Trưởng ban Ban Dân vận Thành ủy; Phó Chủ tịch Thường trực Ủy ban MTTQ Việt Nam TPHCM. Các Phó Chủ tịch UBND TPHCM là Phó Trưởng ban Thường trực các lĩnh vực được phụ trách.
Ban Chỉ đạo còn có 33 thành viên là thủ trưởng các sở, ban, ngành thành phố, Chủ tịch UBND TP Thủ Đức và các quận, huyện có dự án trọng điểm.
Ban Chỉ đạo có quyền chỉ đạo, kiểm tra, đôn đốc chủ đầu tư công trình, dự án, các tổ chức tư vấn, các nhà thầu trong thực hiện nhiệm vụ đảm bảo tiến độ, chất lượng công trình; đề xuất mời cơ quan thanh tra, kiểm toán thực hiện kiểm tra đột xuất, định kỳ các công trình, dự án khi thấy cần thiết để phòng ngừa từ xa, từ sớm các sai sót (nếu có). Được triệu tập Thủ trưởng các sở ngành, Ban Quản lý dự án, địa phương có liên quan tham gia các cuộc họp; cung cấp hồ sơ, tài liệu, báo cáo theo yêu cầu của Ban Chỉ đạo.
Đồng thời, được mời các tổ chức, chuyên gia, nhà khoa học để tư vấn, góp ý, phản biện trong quá trình chỉ đạo, nghiên cứu, đề xuất phương hướng, giải pháp, chính sách để triển khai các dự án. Được đề xuất kiểm điểm, thay thế Chủ đầu tư, Nhà thầu tham gia hoạt động xây dựng có năng lực, kinh nghiệm yếu kém, không đáp ứng yêu cầu tiến độ dự án hoặc triển khai dự án không đảm bảo chất lượng, hiệu quả đầu tư.
Ban Chỉ đạo có nhiệm vụ nghiên cứu, tham mưu UBND TPHCM, Chủ tịch UBND TPHCM chỉ đạo, triển khai đầu tư các dự án trọng điểm và đẩy nhanh tiến độ thực hiện các dự án trọng điểm trên địa bàn thành phố (gồm: tuyến Metro số 1, Metro số 2, đường Vành đai 3, đường Vành đai 4, Rạch Xuyên Tâm, Tham Lương - Bến Cát, Khu Công nghệ Môi trường Xanh,... và các dự án khác). Đồng thời, kết hợp với việc khai thác các quỹ đất xung quanh dự án trọng điểm trên địa bàn Thành phố (rà soát quy hoạch đô thị, điều chỉnh quy hoạch, thu hồi đất, tái định cư, đầu tư hạ tầng kết nối, công tác đấu thầu,...).
Cùng với đó, nghiên cứu và xây dựng mô hình phát triển đô thị theo định hướng phát triển giao thông công cộng (TOD) là mô hình lấy định hướng phát triển hệ thống giao thông công cộng làm cơ sở cho quy hoạch, nghiên cứu phát triển quỹ đất và nâng cao hiệu quả sử dụng đất, công trình công cộng, để chỉnh trang phát triển đô thị góp phần giảm ùn tắc giao thông và ô nhiễm môi trường.
Ban Chỉ đạo thực hiện rà soát và đề xuất UBND TPHCM các dự án ưu tiên đầu tư kết cấu hạ tầng giao thông, hạ tầng kỹ thuật, hạ tầng xã hội để khai thác hiệu quả quỹ đất xung quanh nhà ga và dọc tuyến Metro số 1, Metro số 2, dọc tuyến đường Vành đai 3, đường Vành đai 4, Rạch Xuyên Tâm, Tham Lương - Bến Cát, Khu Công nghệ Môi trường Xanh và các dự án khác.
Bên cạnh đó, tổ chức rà soát phạm vi, quy mô đầu tư, phương án kỹ thuật, công nghệ, tác động môi trường, tổng mức đầu tư dự án, quỹ đất công dọc tuyến đường và quy hoạch đất nông nghiệp tại khu ít dân cư để tạo quỹ đất sạch.
Ban Chỉ đạo cũng theo dõi, đôn đốc việc rà soát quy hoạch đô thị, điều chỉnh quy hoạch, điều chỉnh dự án đầu tư, thu hồi đất, tái định cư, đầu tư hạ tầng kết nối, công tác đấu thầu để đảm bảo đồng bộ. Đồng thời, tham gia chỉ đạo giải quyết các khó khăn, vướng mắc, các khiếu nại, khiếu kiện phát sinh trong quá trình triển khai dự án như các bất cập, có sự chồng chéo, mâu thuẫn giữa các quy định pháp luật; giải phóng mặt bằng, mặt bằng thi công…
