Theo Sở GTVT TPHCM, để Bến xe miền Đông mới hoạt động ổn định, Sở GTVT đề nghị Tổng Công ty Cơ khí giao thông vận tải Sài Gòn TNHH một thành viên và Công ty TNHH một thành viên Bến xe miền Đông chấm dứt thời gian lưu đậu và đón trả khách tại Bến xe miền Đông hiện hữu đối với các tuyến vận tải hành khách được di dời giai đoạn 1 (68 tuyến đi các tỉnh phía Bắc) sang Bến xe miền Đông mới. Phối hợp với Trung tâm Quản lý giao thông công cộng tăng cường công tác thông tin, tuyên truyền phương án tổ chức trung chuyển, tổ chức kết nối các tuyến buýt nội thành và các phương thức hỗ trợ về hành lý, hàng hóa thuận lợi cho hành khách sử dụng và tiếp cận.
Trung tâm Quản lý giao thông công cộng tiếp tục thông tin về các tuyến buýt phục vụ thực hiện trung chuyển, kết nối, các phương thức hỗ trợ về hành lý, hàng hóa, biểu đồ giờ hoạt động, hạ tầng kết nối dọc tuyến; tiếp tục rà soát các tuyến buýt kết nối với Bến xe miền Đông mới.
Sở GTVT TPHCM đề nghị Công an TPHCM, UBND TP Thủ Đức, UBND quận Bình Thạnh phối hợp, chỉ đạo lực lượng chức năng tăng cường kiểm tra và xử lý theo quy định các trường hợp vi phạm hoạt động đón trả khách tại khu vực lân cận và xung quanh Bến xe miền Đông hiện hữu (292 đường Đinh Bộ Lĩnh, phường 26, quận Bình Thạnh, TPHCM). Cụ thể, tình hình đón trả khách tại hai bãi xe: số 391 và 397 đường Đinh Bộ Lĩnh, phường 26, quận Bình Thạnh, TPHCM.
Đồng thời, tổ chức kiểm tra xử lý, chấn chỉnh hoạt động kinh doanh vận tải hành khách bằng xe ô tô trên địa bàn TPHCM theo chỉ đạo của UBND TP. Song song đó, đề xuất lắp đặt các loại biển báo như: cấm xe lưu thông, cấm dừng xe và đỗ xe... tại các vị trí hoạt động gây mất trật tự an toàn giao thông; rà soát mục đích sử dụng đất đối với các điểm trả khách trong khuôn viên, địa điểm kinh doanh. Thanh tra Sở GTVT TPHCM phối hợp với lực lượng công an, CSGT và chính quyền địa phương kiểm tra chuyên đề về hoạt động của xe vận tải khách theo hợp đồng và các điểm thường xuyên có hoạt động đón trả khách trái phép; phát hiện và xử lý nghiêm.