ĐHQG TPHCM hiện đã triển khai tự chủ cho 6/7 trường thành viên, đã có nhiều đơn vị trực thuộc tự chủ tài chính. Tuy nhiên, đến nay, Luật Giáo dục đại học sửa đổi và bổ sung (Luật 34) đã có hiệu lực trên 3 năm (từ 1-7-2019) nhưng Chính phủ vẫn chưa ban hành Quy chế hoạt động của ĐHQG TPHCM theo luật định (ĐHQG TPHCM và các đơn vị thành viên, trực thuộc đều hoạt động theo những quy chế cũ, khi chưa có các đơn vị tự chủ theo Luật 34).
Theo các thành viên Hội đồng ĐHQG TPHCM, đây là một việc hệ trọng và cấp bách mà Hội đồng ĐHQG TPHCM, ĐHQG TPHCM cần nhận thức và nghiên cứu triển khai một cách nghiêm túc. Quy chế của ĐHQG theo luật định phải do Chính phủ ban hành, tuy nhiên, với quá trình phát triển của ĐHQG TPHCM từ hơn 20 năm qua, việc soạn thảo, ban hành quy chế tạm thời về tổ chức và hoạt động ĐHQG TPHCM là hoàn toàn khả thi.
Quy chế của Chính phủ chủ yếu mở rộng nhiệm vụ, quyền hạn cho ĐHQG TPHCM. Hơn nữa, theo luật, trong quy chế còn có những quy trình, quy chế nội bộ, từ nội dung đến hình thức, phải do chính ĐHQG TPHCM, Hội đồng ĐHQG TPHCM quyết định, nhằm đảm bảo sự linh hoạt, sát với thực tiễn của hệ thống ĐHQG TPHCM và các trường thành viên.
Quy chế này càng cấp thiết khi mô hình, vị trí và hoạt động của ĐHQG đang được xã hội rất quan tâm, kỳ vọng, song song với việc Thủ tướng cho thành lập thêm đại học đa lĩnh vực thời gian gần đây.
