Cáo trạng nêu, tại dự án chợ đầu mối (huyện Vĩnh Tường, tỉnh Vĩnh Phúc) được cấp phép cho Công ty Sông Hồng Thăng Long làm chủ đầu tư, tổng mức đầu tư 2.290 tỷ đồng. Cuối năm 2016, do chủ đầu tư không triển khai được các phần việc, Nguyễn Văn Hậu (Chủ tịch HĐQT Tập đoàn Phúc Sơn) đã nhiều lần gặp bà Hoàng Thị Thúy Lan (lúc đó là Bí thư Tỉnh ủy Vĩnh Phúc) để trao đổi về 1 số dự án tại địa phương (trong đó có dự án chợ đầu mối). Gặp bà Lan, Hậu đặt vấn đề và nhờ giúp đỡ để Hậu mua lại cổ phần của chủ đầu tư dự án chợ đầu mối. Bà Lan sau đó đồng ý và chỉ đạo cấp dưới hỗ trợ Hậu.
Quy trình sau đó, Hậu gặp ông Phạm Hoàng Anh (lúc đó là Phó Bí thư Thường trực Tỉnh ủy Vĩnh Phúc) để đặt vấn đề và được đồng ý. Công ty Sông Hồng Thăng Long sau đó được đổi thành Công ty Thăng Long để thực hiện dự án chợ đầu mối.
Quá trình xin ý kiến Bộ Xây dựng về việc chấp thuận chủ đầu tư và cho phép chuyển quyền sử dụng đất, Bộ Xây dựng sau đó trả lời “hồ sơ còn thiếu”. Mặc dù vậy, ông Phạm Hoàng Anh vẫn tiếp tục ký văn bản gửi các sở, ngành chấp thuận đầu tư dự án và Phó Bí thư Thường trực Tỉnh ủy Vĩnh Phúc tiếp tục ký tờ trình đề nghị chấp thuận đầu tư dự án trên với tổng mức đầu tư lên 2.400 tỷ đồng.
Theo chỉ đạo của bà Hoàng Thị Thúy Lan, ông Lê Duy Thành (thời điểm 2018 là Chủ tịch UBND tỉnh Vĩnh Phúc) ký quyết định phê duyệt điều chỉnh dự án.
Cáo trạng nêu, quá trình thực hiện dự án, Nguyễn Văn Hậu đã nhiều lần gặp, nhờ bà Lan, ông Thành, ông Anh tạo điều kiện, hợp thức thủ tục thực hiện dự án trên trái quy định. Dự án chợ đầu mối thuộc diện phải chấm dứt hợp đồng, thu hồi, nhưng vẫn được tỉnh Vĩnh Phúc cho điều chỉnh chủ đầu tư, gia hạn tiến độ thực hiện.
Sau khi Công ty Thăng Long làm chủ đầu tư dự án mà không phải đấu giá quyền sử dụng đất và được điều chỉnh kéo dài tiến độ, ngày 1-6-2018, tỉnh Vĩnh Phúc giao hơn 122.000m2 đất “sạch” cho Công ty Thăng Long của Nguyễn Văn Hậu. Sau khi biết được số tiền phải nộp thuế đất cao, Nguyễn Văn Hậu tiếp tục gặp bà Hoàng Thị Thúy Lan để “mặc cả”. Bà Lan sau đó chỉ đạo Giám đốc Sở Tài chính Vĩnh Phúc “kiểm tra lại cách tính”. Số tiền sau đó giảm từ 708 tỷ đồng xuống còn 507 tỷ đồng (số tiền chênh hơn 200 tỷ đồng được xác định là thiệt hại cho Nhà nước).
Cơ quan công tố xác định, từ việc phê duyệt chủ đầu tư không đúng quy định, Nguyễn Văn Hậu đã đưa cho bà Hoàng Thị Thúy Lan cùng lãnh đạo tỉnh, sở, ngành tỉnh Vĩnh Phúc tổng số tiền hơn 49,9 tỷ đồng và hơn 2,3 triệu USD tại nhà riêng, phòng làm việc. Trong đó, bà Hoàng Thị Thúy Lan ở giai đoạn tháng 7-2017 đến 2022 đã nhận của Nguyễn Văn Hậu 3 lần tiền, tổng số 25 tỷ đồng và 1 triệu USD.
