Theo Bộ GD-ĐT, tại khoản 3, điều 3 Quy chế tuyển sinh ĐH hệ chính quy, tuyển sinh cao đẳng nhóm ngành đào tạo giáo viên chính quy hiện hành (gọi tắt là Quy chế tuyển sinh ĐH-CĐ) đã quy định: “Tất cả các trường đều phải xây dựng và công khai đề án tuyển sinh trên trang thông tin điện tử của trường và trên Cổng thông tin tuyển sinh của Bộ GD-ĐT trước khi thí sinh đăng ký dự thi kỳ thi THPT Quốc gia, chịu trách nhiệm giải trình về các nội dung của đề án”.
Công văn số 603 của Bộ GD-ĐT ngày 17-2 về hướng dẫn công tác tuyển sinh đã yêu cầu “các trường ĐH, CĐ công bố đề án tuyển sinh 2017 trước ngày 20-3-2017”.
Thế nhưng vào thời điểm này, khi thí sinh đã hoàn thành đăng ký dự thi, đăng ký xét tuyển và ngày thi đã đến rất gần thì trường lại thông báo chỉ tuyển những thí sinh có hộ khẩu tại TPHCM thay vì tuyển sinh trên phạm vi cả nước như trước đó.
Việc thay đổi khu vực tuyển sinh theo thông báo số 1771 của Trường ĐH Y khoa Phạm Ngọc Thạch TPHCM là không phù hợp với Quy chế tuyển sinh ĐH-CĐ. Điều này làm ảnh hưởng đến quyền lợi và gây băn khoăn, lo lắng cho nhiều thí sinh ở các tỉnh, thành phố khác ngoài TPHCM đã đăng ký xét tuyển vào trường.
Do đó, Bộ GD-ĐT yêu cầu Trường ĐH Y khoa Phạm Ngọc Thạch TPHCM thực hiện đúng Quy chế tuyển sinh ĐH-CĐ và đúng các nội dung trong đề án tuyển sinh mà nhà trường đã công bố trước đó với Bộ GD-ĐT.