Chủng virus này đã phát hiện tại Việt Nam từ năm 2014, thỉnh thoảng vẫn xuất hiện một số ổ dịch nhỏ lẻ và đều được xử lý triệt để.
Để dập tắt ổ dịch mới manh nha này, Cục Thú y đã cử cán bộ thú y vùng IV (Đà Nẵng) phối hợp với tỉnh Phú Yên, lực lượng chuyên môn của tỉnh này để xử lý; tiêu hủy 2.900 con gia cầm của 2 gia đình tại ổ dịch; vệ sinh tiêu độc, khử trùng toàn bộ khu vực ổ dịch. Phú Yên đã cấp 5.000 lít hóa chất sát trùng, 300.000 liều vaccine để tiêm phòng bao vây ổ dịch tại toàn bộ khu vực đang có ổ dịch. Theo Cục Thú y, virus cúm A/H5N6 tái xuất báo hiệu nguy cơ dịch cúm gia cầm phát sinh và lây lan trong thời gian tới; một số loại virus cúm A/H7N9, A/H5N2, A/H5N8 có nguy cơ xâm nhiễm vào Việt Nam.