Theo bản án, hội đồng xét xử quyết định tuyên phạt các bị cáo ở nhóm tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng” và “Đưa hối lộ”:
1. Phan Quốc Việt (Chủ tịch HĐQT, Tổng Giám đốc Công ty Việt Á) 29 năm tù, cộng với bản án 25 năm tù mà Tòa án Quân sự Thủ đô Hà Nội tuyên phạt trước đó, tổng hợp hình phạt buộc bị cáo Việt chấp hành là 30 năm tù (theo quy định, một người phạm nhiều tội và bị đưa ra xét xử ở nhiều vụ án khác nhau, hình phạt cao nhất của các bản án mà họ bị xét xử chỉ là hình phạt tù có thời hạn, thì khi đó tổng hợp hình phạt tù không quá 30 năm).
2. Vũ Đình Hiệp (Phó Tổng Giám đốc Công ty Việt Á, bị Tòa án Quân sự Thủ đô Hà Nội tuyên phạt 6 năm tù, bản án chưa có hiệu lực pháp luật) 15 năm tù cho 2 tội danh.
Nhóm bị cáo phạm tội “Nhận hối lộ”:
3. Trịnh Thanh Hùng (cựu Phó Vụ trưởng Vụ KH-CN các ngành kinh tế - kỹ thuật, Bộ KH-CN, bị Tòa án Quân sự Thủ đô Hà Nội tuyên phạt 15 năm tù, bản án chưa có hiệu lực pháp luật) 14 năm tù.
4. Nguyễn Thanh Long (cựu Bộ trưởng Bộ Y tế) 18 năm tù.
5. Nguyễn Huỳnh (cựu Phó trưởng Phòng giá, Cục Quản lý Dược, Bộ Y tế) 9 năm tù.
6. Nguyễn Minh Tuấn (cựu Vụ trưởng Vụ Trang thiết bị công trình, Bộ Y tế) 8 năm tù.
7. Nguyễn Nam Liên (cựu Vụ trưởng Vụ Kế hoạch - Tài chính, Bộ Y tế) 7 năm tù.
8. Phạm Duy Tuyến (cựu Giám đốc CDC Hải Dương) 13 năm tù.
Nhóm bị cáo phạm tội “Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí”:
9. Chu Ngọc Anh (cựu Bộ trưởng Bộ KH-CN) 3 năm tù.
10. Phạm Công Tạc (cựu Thứ trưởng Bộ KH-CN) 3 năm tù.
Nhóm bị cáo phạm tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ”:
11. Nguyễn Văn Trịnh (cựu Trợ lý Phó Thủ tướng) 4 năm tù.
12. Phạm Xuân Thăng (cựu Bí thư Tỉnh ủy Hải Dương) 5 năm tù.
13. Phạm Mạnh Cường (cựu Giám đốc Sở Y tế Hải Dương) 4 năm tù.
Nhóm bị cáo với cáo buộc phạm tội “Đưa hối lộ”:
14. Phạm Tôn Noel Thảo (Trợ lý tài chính Công ty Việt Á) 4 năm tù.
15. Hồ Thị Thanh Thảo (Thủ quỹ Công ty Việt Á) 4 năm tù.
Nhóm bị cáo phạm tội “Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng”:
16. Trần Thị Hồng (nhân viên Công ty Việt Á) 30 tháng tù.
17. Lê Trung Nguyên (nhân viên Công ty Việt Á) 30 tháng tù.
18. Trần Tiến Lực (nhân viên Công ty Việt Á) 36 tháng tù.
19. Nguyễn Mạnh Cường (cựu Kế toán trưởng CDC Hải Dương) 30 tháng tù.
20. Nguyễn Thị Trang (cựu Giám đốc Trung tâm Tư vấn và Dịch vụ tài chính, Sở Tài chính tỉnh Hải Dương) 30 tháng tù, cho hưởng án treo.
21. Lâm Văn Tuấn (cựu Giám đốc CDC Bắc Giang) 5 năm tù.
22. Ngụy Thị Hậu (cựu Phó trưởng Phòng Tài chính, CDC Bắc Giang) 30 tháng tù.
23. Phan Huy Văn (Giám đốc Công ty Dược vật tư y tế Phan Anh, tỉnh Bắc Giang) 36 tháng tù.
24. Phan Thị Khánh Vân (lao động tự do) 36 tháng tù.
25. Vũ Văn Doanh (Giám đốc Công ty Thẩm định giá Thăng Long) 24 tháng tù, cho hưởng án treo.
26. Tạ Ngọc Chức (Giám đốc Công ty Thẩm định và đầu tư Toàn Cầu) 20 tháng tù.
27. Nguyễn Văn Định (cựu Giám đốc CDC Nghệ An) 2 năm 12 ngày (bằng thời gian tạm giam).
28. Nguyễn Thị Hồng Thắm (cựu Kế toán trưởng CDC Nghệ An) 2 năm 12 ngày (bằng thời gian tạm giam).
29. Hồ Công Hiếu (Thẩm định viên Công ty Thẩm định giá Miền Nam, Chi nhánh Nghệ An) 24 tháng tù, cho hưởng án treo.
30. Nguyễn Thành Danh (cựu Giám đốc CDC Bình Dương) được miễn trách nhiệm hình sự.
31. Tiêu Quốc Cường (cựu Kế toán trưởng Sở Y tế tỉnh Bình Dương) 36 tháng tù.
32. Lê Thị Hồng Xuyên (nhân viên CDC Bình Dương) 24 tháng tù.
33. Trần Thanh Phong (Phó trưởng Phòng tài chính, CDC Bình Dương) 24 tháng tù, cho hưởng án treo.
34. Nguyễn Trường Giang (Tổng Giám đốc Công ty VNDAT) 30 tháng tù.
35. Nguyễn Thị Thúy (Giám đốc dự án Công ty VNDAT) 26 tháng tù.
36. Ninh Văn Sinh (cựu Phó Giám đốc Công ty thẩm định giá Trung Tín) 18 tháng tù.
Nhóm bị cáo phạm tội “Lợi dụng ảnh hưởng đối với người có chức vụ, quyền hạn để trục lợi”:
37. Nguyễn Thị Thanh Thủy (cựu chuyên viên Nhà Xuất bản Giáo dục) 30 tháng tù.
38. Nguyễn Bạch Thùy Linh (Giám đốc Công ty SNB Holdings) 30 tháng tù, cho hưởng án treo.