Điểm đáng chú ý trong báo cáo là việc có vốn đầu tư trực tiếp nước ngoài (FDI) luôn dẫn đầu về thua lỗ. Cụ thể, các năm 2008 - 2009, tỷ lệ doanh nghiệp FDI thua lỗ lần lượt là 51,2% và 49,8% nhưng vẫn mở rộng đầu tư tại Việt Nam.
Theo bà Phạm Thị Thu Hằng, Tổng Thư ký VCCI, trong cả giai đoạn 2007 - 2015, tỷ lệ FDI thua lỗ cũng chiếm trên 40%, cho thấy dường như vấn đề chuyển giá vẫn chưa được giải quyết. Doanh nghiệp FDI mặc dù báo lỗ rất nhiều nhưng hiệu suất sinh lợi trên tài sản (ROA) lại khá nhất, luôn đứng đầu trong các khu vực doanh nghiệp.
Cũng theo báo cáo, doanh nghiệp FDI chỉ giảm lỗ khi Chính phủ đưa ra một số giải pháp để kiểm soát việc chuyển giá thông qua việc thanh tra năm 2010 và 2011. Trong thời gian đó, tỷ lệ thua lỗ đã giảm xuống còn 44,2% và 45%. Tuy nhiên, giai đoạn 2012 - 2015, tỷ lệ doanh nghiệp FDI thua lỗ tăng cao trở lại cùng với xu hướng khó khăn chung của nền kinh tế. Riêng năm 2015, tỷ lệ thua lỗ của doanh nghiệp FDI xuống vị trí thứ hai, sau khu vực doanh nghiệp nhà nước.
